M数据库
Materials Project
通过计算材料数据与分析工具支持新材料发现和性质探索。
材料数据库计算材料
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化学与材料
分子、反应与材料计算。当前收录 51 项工具、模型、数据库或基础设施资源。
G模型
GNoME
Google DeepMind 用图网络预测新材料稳定性的研究模型与数据成果。
材料发现图神经网络
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MatterGen
微软研究院开发的无机材料生成模型，可按目标性质提出候选结构。
生成模型无机材料
查看详情 IAI 工具
IBM RXN for Chemistry
利用机器学习进行化学反应预测与逆合成；官方已宣布服务将于 2026 年 10 月 28 日结束。
反应预测逆合成
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ChemDraw
用于绘制化学结构、反应式并处理化学信息的专业软件。
化学绘图结构式
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RDKit
开源化学信息学工具包，支持分子表示、描述符、搜索与建模。
化学信息学Python
查看详情 P数据库
PubChem
NCBI 提供的开放化学信息数据库，收录化合物、物质与生物活性。
化学数据库化合物
查看详情 C数据库
ChEMBL
EMBL-EBI 维护的开放药物样分子、靶点与生物活性数据库。
药物数据生物活性
查看详情 C数据库
CAS SciFinder
检索化学物质、反应、文献与供应信息的专业研究平台。
化学检索反应
查看详情 Q科研基础设施
Quantum ESPRESSO
基于平面波和赝势方法的开源电子结构计算软件套件。
量子化学电子结构
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AutoDock Vina
用于预测小分子与受体结合构象并进行打分的开源分子对接程序。
分子对接虚拟筛选
查看详情 O科研基础设施
OpenMM
支持 GPU 加速和 Python 接口的开源分子模拟工具包。
分子动力学GPU
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OpenFE
用于设置、执行和分析相对结合自由能计算的开放工具包与社区项目。
自由能计算药物发现
查看详情 D模型
DiffDock
使用扩散生成方法预测蛋白质与小分子配体结合构象的研究代码。
分子对接扩散模型
查看详情 AAI 工具
AiZynthFinder
使用蒙特卡洛树搜索和反应模型进行合成路线规划的开源工具。
逆合成路线规划
查看详情 RAI 工具
REINVENT 4
使用循环神经网络和 Transformer 进行生成式分子设计与多目标优化的开源命令行工具。
分子生成药物设计
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pymatgen
用于表示、转换和分析材料结构与计算结果的开源 Python 库。
材料信息学Python
查看详情 A科研基础设施
Atomic Simulation Environment
用于设置、运行和分析原子尺度模拟的开源 Python 工具集。
原子模拟Python
查看详情 L科研基础设施
LAMMPS
用于粒子体系经典分子动力学模拟的开源并行计算软件。
分子动力学并行计算
查看详情 N数据库
NOMAD
面向材料科学计算数据的开放存储、标准化、检索与分析平台。
材料数据数据基础设施
查看详情 A数据库
AFLOW
提供高通量材料计算数据、原型库和在线检索接口的研究平台。
高通量计算材料数据库
查看详情 D科研基础设施
DeePMD-kit
训练深度神经网络原子间势并用于分子模拟的开源软件包。
机器学习势分子模拟
查看详情 S科研基础设施
SchNetPack
用于开发和训练原子机器学习模型的开源 PyTorch 工具箱。
原子机器学习PyTorch
查看详情 O数据库
OQMD
提供基于密度泛函理论计算的材料结构、形成能和稳定性数据的开放量子材料数据库。
材料数据库DFT
查看详情 N科研基础设施
NequIP
用于训练 E(3) 等变机器学习原子间势的开源框架，可与 ASE 和 LAMMPS 工作流集成。
机器学习势等变神经网络
查看详情 M科研基础设施
MACE
以高阶等变消息传递训练和运行机器学习原子间势的开源 PyTorch 框架。
机器学习势原子模拟
查看详情 C模型
CHGNet
面向电荷信息原子建模的预训练图神经网络势及开源推理、微调工具。
神经网络势材料模拟
查看详情 M科研基础设施
MatGL
用于材料与化学图深度学习、性质预测和机器学习势开发的开源 Python 库。
材料图学习机器学习势
查看详情 D科研基础设施
DScribe
将原子结构转换为 SOAP、MBTR 等固定长度数值描述符的开源 Python 软件包。
原子描述符材料机器学习
查看详情 P科研基础设施
phonopy
在谐波和准谐波近似下计算声子谱、态密度和热力学性质的开源软件。
声子计算晶格动力学
查看详情 G科研基础设施
GPAW
基于投影缀加波方法并与 ASE 集成的开源 Python 密度泛函理论计算软件。
DFT电子结构
查看详情 C科研基础设施
CP2K
用于固体、液体、分子和生物体系量子化学及原子模拟的开源高性能软件。
量子化学原子模拟
查看详情 V科研基础设施
VASP
用于第一性原理电子结构、材料性质和量子分子动力学计算的专有科研软件。
第一性原理电子结构
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ABINIT
用于材料和分子 DFT、微扰理论及多体电子结构计算的开源软件套件。
DFT多体计算
查看详情 S科研基础设施
SIESTA
使用严格局域原子轨道进行分子与固体电子结构和第一性原理分子动力学计算的开源软件。
DFT局域轨道
查看详情 O科研基础设施
OpenMX
以赝原子局域基组开展纳米材料电子结构、分子动力学和输运计算的开源软件。
DFT纳米材料
查看详情 D科研基础设施
DOCK 6
用于小分子对接、虚拟筛选和结合构象评分的开源命令行软件套件。
分子对接虚拟筛选
查看详情 A科研基础设施
Amber
面向生物分子模拟的分子动力学软件套件；AmberTools 主要为开源组件，Amber26 采用单独许可证。
分子动力学生物分子模拟
查看详情 S科研基础设施
Schrödinger Platform
覆盖分子建模、模拟、信息学和计算药物及材料研究的专有集成软件平台。
分子建模计算药物发现
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MOE
Molecular Operating Environment 的简称，是集分子建模、药物设计、化学信息学和模拟于一体的专有平台。
分子建模药物设计
查看详情 C科研基础设施
Chemprop
基于消息传递神经网络训练分子与反应性质预测模型的开源机器学习软件包。
分子性质预测图神经网络
查看详情 O科研基础设施
Open Babel
用于转换、筛选和处理多种化学文件格式的开源化学信息学工具箱，提供命令行、图形界面和程序接口。
化学文件格式化学信息学
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PySCF
以 Python 为主要接口的开源量子化学框架，支持分子和周期体系的多类电子结构计算。
量子化学电子结构
查看详情 P科研基础设施
Psi4
提供 Hartree–Fock、密度泛函、微扰、耦合簇和分子间相互作用等方法的开源量子化学软件。
量子化学从头计算
查看详情 X科研基础设施
xTB
实现 GFN 系列半经验扩展紧束缚方法与相关力场的开源程序，可计算能量、结构、频率和分子动力学。
半经验量子化学紧束缚方法
查看详情 C科研基础设施
CREST
用于自动探索分子低能化学空间并生成构象体、旋转异构体及相关结构集合的开源命令行程序。
构象采样分子结构集合
查看详情 A科研基础设施
Avogadro
用于构建、编辑、可视化和检查分子与材料结构的开源跨平台桌面应用，并支持插件和计算结果解析。
分子编辑三维可视化
查看详情 P科研基础设施
PLUMED
可与多种分子动力学引擎结合的开源库和命令行工具，提供增强采样、自由能计算、集体变量和轨迹分析方法。
增强采样自由能计算
查看详情 M科研基础设施
MDAnalysis
用于读取、选择、转换和分析多种分子动力学轨迹与拓扑格式的开源 Python 库。
分子动力学轨迹分析
查看详情 O科研基础设施
ORCA
通用量子化学软件包，提供密度泛函、相关波函数、多参考和光谱等电子结构方法。
量子化学电子结构
查看详情 N科研基础设施
NAMD
面向大型生物分子体系高性能模拟的并行分子动力学程序，支持多核、集群和 GPU 平台。
分子动力学高性能计算
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